Пять миллионов человек по всему миру ежегодно получают укус ядовитых змей, из которых примерно 100 000 умирают.
Международная команда исследователей секвенировала геном индийской кобры, с целью достижения эффективного и дешевого противоядия против ее смертельного укуса.
Исследовательская группа, возглавляемая Сомасекаром Сешагири из Исследовательского фонда SciGenome в Бангалоре (Индия), сумела собрать высококачественную геномную последовательность индийской кобры, одной из самых ядовитых змей на планете.
Ежегодно около пяти миллионов человек во всем мире подвергаются укусам ядовитых змей, из которых примерно 400 000 человек теряют конечности и около 100 000 умирают .
В настоящем исследовании, опубликованном в научном журнале «Nature Genetics», Сешагири и его коллеги использовали различные технологии длинного и короткого считывания секвенирования для построения высококачественного генома индийской кобры, вида медицинской релевантной змеи из-за ее высокотоксичной природы. Они также использовали хромосомные контактные данные и оптическое картирование.
В своих исследованиях они собрали ткани из 14 различных кобр, которые они использовали для прогнозирования 31 447 транскриптов и 23 248 генов, кодирующих белок. Они обнаружили 19 генов, которые были связаны с производством токсинов в ядовитой железе и проверили белки, которые были произведены из-за этих генов. В то же время они сравнили свои результаты с имеющимися данными от гремучих змей прерии, определив, что 15 из найденных ими генов токсина были исключительно для индийской кобры.
В настоящее время метод достижения антидота заключается в введении небольшого количества яда в большое животное, такое как лошадь, и извлечении полученных антител, которые генерирует животное. Проблема этого подхода заключается в том, что он является дорогостоящим и не всегда является действенным, что можно решить с открытием Сешагири и его команды.
По мнению исследователей, это открытие могло бы позволить провести дальнейшие исследования по разработке синтетического рекомбинантного яда для использования в создании противоядия.
«Этот высококачественный геном позволил нам изучить различные аспекты биологии змеиного яда, такие как ядовитая геномная организация, генетическая изменчивость, эволюция и экспрессия ключевых ядовитых генов”, — говорят исследователи, добавляя, что геном индийской кобры был богатым источником для разработки более надежных противоядий в будущем.
На сегодняшний день опубликовано лишь несколько геномов змей. Однако, как только геномы змей более высокого качества будут завершены, синтетические антитела, направленные против ключевых ядов определенных в таких исследованиях можно совместить для произведения эффективных антитоксинов широкого спектра.
